林业论文_不同预处理方式下肉桂枝叶内生细菌物

文章目录

1 材料与方法

1.1 材料与试剂

1.2 仪器与设备

1.3 生物预处理

1.4 提取内生菌

1.5 数据处理

    1.5.1 数据去杂

    1.5.2 得到最优数据

    1.5.3 数据评估分析

    1.5.4 组间数据显著差异性检验

2 结果与分析

2.1 测序数据统计

2.2 物种注释与评估

2.3 物种组成分析

    2.3.1 Venn图分析

    2.3.2 群落组成分析

2.4 参试样本比较分析

2.5 物种差异分析

    2.5.1 组间差异显著性检验

    2.5.2 多级物种差异判别分析

3 结论与讨论

文章摘要:利用基因测序技术对空白组（C）和经过生物预处理的2组（水预处理组,W;酵母液预处理组,Y）肉桂枝叶18个样本的内生菌进行基因测序。物种组成分析发现C组特有物种数为56个,W组为50个,而Y组达到了100个;3组样本中的变形菌门等丰度较高,总丰度占比达到了96%。对18个样本进行比较分析发现Y₂和W₄具有显著差异性。物种差异分析对比C组发现3组样本中厚壁菌门等为显著差异。对W、Y2组进行LEfSe多级物种差异判别分析发现W组中甲基杆菌门的丰度对差异效果影响最大;Y组中,厚壁菌门对组间差异存在最显著影响,同时其丰度对差异效果影响也是最大。

文章关键词:

项目基金:《林业科技通讯》 网址: http://www.lykjtx.cn/qikandaodu/2022/0111/1352.html